مرحله دوم مطالعات با رویکردی دستاورد محور از پاییز 1384 تا پاییز سال 1387 به طول انجامید. ماحصل این مرحله از مطالعات دستاوردهای موضوعی 9 گانه طرح، شامل محورهای زیر بود:
· تعیین محدوده و مرزبندی مناطق ساحلی کشور؛
· بررسی جایگاه سیاسی و امنیتی سواحل کشور؛
· تدوین برنامه مدیریت نوار ساحلی کشور؛
· تهیه برنامه مدیریت زیست محیطی سواحل کشور؛
· مطالعات حقوق و قوانین مدیریت یکپارچه مناطق ساحلی کشور؛
· تهیه طرح کاربری مطلوب اراضی مناطق ساحلی کشور؛
· طراحی ساختار و سازمان اجرایی طرح ICZM در کشور؛
· ایجاد و مدیریت پایگاه اطلاعات جغرافیایی مدیریت سواحل کشور؛
· تدوین برنامه پایش و ارزشیابی اجرای ICZM در کشور.